方柏山
博士生导师
电话:18150117973
Email:fbs@xmu.edu.cn
个人简历
方柏山, 男,1957年生于北京,籍贯福建莆田,工学博士,闽江学者特聘教授,博士生导师。
学历:
1978.03-1982.01 浙江大学化学工程专业,获工学学士学位
1996.09-2000.06 天津大学化学工程专业,获工学博士学位
留学:
1991.10-1993.04 德国斯图加特大学生物化工研究所访问(教育部选拔,德国学术交流中心奖学金资助)
2000.08-2001.08 德国生物技术研究中心(GBF)访问(教育部选拔,国家留学基金)
2018.11-2019.01 美国华盛顿大学高级研究学者(国家留学基金管理委员会)
职称:
1982.02-1988.07 华侨大学化工与生化工程系,助教
1988.07-1994.06 华侨大学化工与生化工程系,讲师
1994.06-1998.07 华侨大学化工与生化工程系,副教授(1995年~2010年被聘为化学工程、生物化工、微生物、生物化学与分子生物学专业硕士生导师)
1998.07-2008.09 华侨大学化工学院,教授(破格,2003年被聘为天津大学生物化工专业合作博导、2004年~2008年被聘为华侨大学生物化工专业博士生导师)
职务:
1993.04-1998.06 华侨大学化工与生化工程系生化工程教研室副主任、主任、系副系主任(主持工作)
1998.06-2000.08 华侨大学化工学院常务副院长、常务副院长(主持工作)
2000.09-2001.05 华侨大学材料科学与工程学院(原化工学院)常务副院长(出国)
2002.03-2008.06 华侨大学材料科学与工程学院院长(福建省高校生物化工重点学科学科带头人、福建省高校工业生物技术重点实验室主任、工业生物技术研究所所长、福建省高等学校创新团队培育计划“工业生物技术”团队带头人)
2008.09~ 闽江学者特聘教授、博士生导师;厦门大学化学化工学院化学工程与生物工程系生物化工研究所所长(~2018.09);厦门市合成生物技术重点实验室主任(2014~)
学术兼职:
中国微生物学会生化过程模型化与优化专业委员会副主任
中国生物化学与分子生物学学会工业生物化学与分子生物学分会常务理事
中国化工学会生物化工专业委员会委员
中国生物工程学会合成生物学专业委员会委员
中国微生态医疗专业委员会委员
中国生态学学会海洋生态专业委员会委员(2014~2018)
福建省生化与分子生物学学会副理事长
福建省化工学会副理事长、生物化工专业委员会主任
福建省微生物学会常务理事
福建省环境科学学会理事
研究方向
合成生物学与生物分子机器; 定向进化与生物催化; 生物技术过程开发与优化; 肠道菌群体外培养与功能开发
教学工作
生物工程本科生
华侨大学任教期间:计算机在生物工程中的应用、生物反应工程(福建省优秀课程)、酶工程(福建省精品课程);
厦门大学:学科入门指导(部分)、化工与生工前沿(部分)、生物过程模型化与优化
生物化工专业硕士生
华侨大学任教期间:生物反应工程、生化过程模型化与控制、生物信息学、酶工程
厦门大学:代谢工程、酶工程
生物化工专业博士生
华侨大学任教期间:生物化工研究进展、代谢工程、生物信息学
厦门大学:生物化工研究前沿(部分);生物技术研究前沿(部分)
工业催化专业博士生(厦门大学):
催化科学与工程前沿(部分)
承担的课题:
1. 国家海洋公益项目,201505032-6,基于海洋微生物发酵的系列新产品开发-苹果酸脱氢酶制备关键工程化技术研究与应用,2016/01-2018/12
2. 厦门南方海洋研究中心项目, 14GYY011NF11,深海微生物氧化还原酶制备L-叔亮氨酸,2014/01-2016/12
3. 国家自然科学基金重点项目,21336009,多酶生物分子机器的可控组装与制备药物的生物化工基础,2014/01-2018/12
4. 国家自然科学基金资助项目,41176111,深海细菌Pseudomonas marincola的氧化还原酶高通量挖掘、特异性研究与应用,2012/01-2015/12
5. 国家自然科学基金资助项目,21076172,并用NADH和NADPH生物转化甘油制备1,3-丙二醇的合成生物系统研究,2011/01-2013/12
6. 福建省高校产学合作科技重大项目,2010H6023,生物转化生物柴油副产物粗甘油生产1,3-丙二醇的新技术开发,2010/03-2013/03
7. 横向课题,木糖醇高产菌株的选育及发酵工艺研究,2012/10- 2015/10
8. 横向课题,全细胞还原合成艾利西平,2011/10-2015/12
近期主要代表论著:
出版著作
独著《生物技术过程模型化与控制》. 暨南大学出版社, 1997
参编《微生物工程》.科学出版社,2004
参编《化工分离前沿》. 厦门大学出版社,2011
副主编《发酵工程原理与技术》. 高等教育出版社,2014
发表论文(2016~)
1. Zhang Ai-Hui, Zhuang Xiao-Yan, Chen Kai-Nan, Huang Shi-Yang, Xu Chao-Zhen, Fang Bai-Shan*. Adaptive evolution of Clostridium butyricum and scale-up for high-concentration 1,3-propanediol production, AiChE Journal. 2019, 65: 32-39.
2. Fu You-Si, Zhang Jun-Nan, Chen Kai-Nan, Xiao Chuan-Xing, Fan Li-Na, Zhang Bang-Zhou, Ren Jian-lin *, Fang Bai-Shan*. An in vitro fermentation study on the effects of Dendrobium officinale polysaccharides on human intestinal microbiota from fecal microbiota transplantation donors, Journal of Functional Foods. 2019, 53: 44-53.
3. Zhang Yong-Hui, Chen Kai-Nan, Zhang Jun-Nan, Ren Hong, Zhang Xin‐Yu, Huang Jing‐Han, Wang Shi-Zhen* Fang Bai-Shan*. Preparation and evaluation of a polymer-metal-enzyme hybrid nanowire for the immobilization of multiple oxidoreductases, Journal of Chemical Technology and Biotechnology. 2019, 94: 795-803.
4. Jiang Wei, Yang Ruo-Nan, Lin Peng, Hong Wen-Jing*, Fang Bai-Shan*. Bioinspired genetic engineering of supramolecular assembled formate dehydrogenase with enhanced biocatalysis activities, Journal of Biotechnology. 2019 doi.org/10.1016/j.jbiotec.2018.12.017
5. Zhang Ai-Hui, Liu Hao-Lin, Huang Shi-Yang, Fu You-Si, Fang Bai-Shan*. Metabolic profiles analysis of 1,3-propanediol production process by Clostridium butyricum through repeated batch fermentation coupled with activated carbon adsorption, Biotechnology and Bioengineering. 2018, 115: 684-693.
6. Lin Peng, Zhang Yong-Hui, Ren Hong, Wang Yi-Xuan, Wang Shi-Zhen*, Fang Bai-Shan. Assembly of graphene oxide-formate dehydrogenase composites by nickel-coordination with enhanced stability and reusability, Engineering in Life Sciences. 2018, 18, 326-333
7. Zhang Yong-Hui, Wang Ya-Li, Wang Shi-Zhen*, Fang Bai-Shan*. Engineering bi-functional enzyme complex of formate dehydrogenase and leucine dehydrogenase by peptide linker mediated fusion for accelerating cofactor regeneration, Engineering in Life Sciences. 2017, 17: 989-996.
8. Jiang Wei, Wang Shi-zhen, Wang Yuan-Peng, Fang, Bai-Shan*. Key enzymes catalyzing glycerol to 1,3-propanediol, Biotechnology for Biofuels. 2016. 9.
9. Zhu Chun-Jie, Fang Bai-Shan*, Wang Shi-Zhen. Effects of culture conditions on the kinetic behavior of 1,3-propanediol fermentation by Clostridium butyricum with a kinetic model, Bioresourous Technology. 2016, 212: 130-137.
10. Wang Wen-Lei, Li Huan-Qin, Lin Xiang-Zhi, Zhang Fang, Fang Bai-Shan*, Wang Zhao-Kai*. The effect of polar auxin transport on adventitious branches formation in Gracilaria lichenoides in vitro. Physiologia Plantarum. 2016, 158: 356-365.
11. Zhang Yong-Hui, Ren Hong, Wang Ya-Li, Chen Kai-Nan, Wang Shi-Zhen, Fang Bai-Shan*. Bioinspired immobilization of glycerol dehydrogenase by metal ion-chelated polyethyleneimines as artificial polypeptides, Scientific Reports. 2016, 6: 24163.
12. Jiang Wei, Li Wen-Jun, Hong Yan, Wang Shi-Zhen, Fang, Fang Bai-Shan*. Cloning, expression, mutagenesis library construction of glycerol dehydratase, and binding mode simulation of its reactivase with ligands. Applied Biochemistry and Biotechnology. 2016. 178(4): 739-752.
13. Lu Ji-Xue, Zhang Yong-Hui, Sun Dong-Fang, Jiang Wei, Wang Shi-Zhen, Fang Bai-Shan*. The development of leucine dehydrogenase and formate dehydrogenase bifunctional enzyme cascade improves the biosynthsis of l-tert-leucine, Applied Biochemistry and Biotechnology. 2016, 180(6): 1180-1195.
14. Jiang Wei, Sun Dong-Fang, Lu Ji-Xue, Wang Ya-Li, Wang Shi-Zhen, Zhang Yong-Hui, Fang Bai-Shan*. A cold-adapted leucine dehydrogenase from marine bacterium Alcanivorax dieselolei: Characterization and l-tert-leucine production, Engineering in Life Sciences. 2016, 16(3): 283-289.
15. Jiang Wei, Fang Bai-Shan*. Construction of a tunable multi-enzyme-coordinate expression system for biosynthesis of chiral drug intermediates, Scientific Reports. 2016, 6: 30462.
16. Jiang Wei, Sun Dong-Fang, Ren Hong, Xu Chao-Zhen, Wang Ya-Li, Zhang Yong-Hui, Wang Shi-Zhen, Fang Bai-Shan*. Isolation, purification and characterization of a salt-active and organic-solvent-thermostable phenylalanine dehydrogenase from Bacillus nanhaiensis DSF-15A2, Journal of Molecular Catalysis B-Enzymatic. 2016, 133: 12-19.
17. Jiang Wei, Fang Bai-Shan*. Construction and evaluation of a novel bifunctional phenylalanine-formate dehydrogenase fusion protein for bienzyme system with cofactor regeneration, Journal of Industrial Microbiology & Biotechnology. 2016, 43(5): 577-584.
18. Jiang Wei, Lin Peng, Yang Ruo-Nan, Fang Bai-Shan*. Identification of catalysis, substrate, and coenzyme binding sites and improvement catalytic efficiency of formate dehydrogenase from Candida boidinii, Applied Microbiology and Biotechnology. 2016, 100(19): 8425-8437.
授权专利:
方柏山,任红,王世珍,一种海洋菌株催化不对称还原制备手性苯丙氨酸的方法,2014-08-08, 中国,ZL201610146280.6;中国,ZL201410389897.1
方柏山,邱隆辉,张蓝蓝,王世珍,一种发酵生产1,3-丙二醇的固定化纤维床反应器,2014.08.1, 中国,ZL201410392120.0
方柏山,严正平,一种利用固定化细胞转化甘油生产乳酸的方法,2015.07.01,中国,ZL 201310576790.3
方柏山,池帅,一种1,3-丙二醇的制备方法,2015.05.13,中国,ZL 201210262830.2
方柏山,温卫卫,周小芬,王世珍,一种筛选辅酶依赖型氧化还原酶的方法,2015.05.13,中国,ZL201210190270.4
方柏山,代洪飞,王世珍,一种用阳离子树脂吸附提取发酵液中1,3-丙二醇的方法,2014.09.10,中国,ZL201210327740.7
方柏山,陈喆,王兆守,一种转化甘油制备二羟基丙酮的方法,2014.09.03,中国,ZL 201110378229.5
方柏山,陈斌,朱春杰,王世珍, 一种生产1,3-丙二醇的菌株筛选方法与应用,2014.03.13,中国,ZL 201210568673.8
方柏山,钟和平,一种对辅酶和辅酶依赖性酶进行偶联固定的方法,2013.03.13,中国,ZL 201010536533.3
方柏山,赵耿,一种转化甘油制备乳酸的方法,2013.03.13,中国,ZL 201110198853.7
获奖情况:
生物炼制关键酶的分子设计及生物催化,福建省自然科学奖三等奖,2014,排名第一
基于国际遗传工程机器设计竞赛(iGEM)的大学生主动实践创新能力培养,福建省第七届高等教育教学成果奖二等奖,2014,排名第一
构建国际平台、强化科研实践、培养生物医药拔尖创新人才,第七届高等教育天津市教育成果奖一等奖,2014,排名第四
全国石油和化工行业教学名师,2015
组建和率领的厦门大学本科生XMU-iGEM获得iGEM竞赛(International Genetically Engineered Machine Competition)金奖(2011、2012、2013、2014、2016、2017、2018年)和银奖(2015年)、本科生XMU-iGEM软件队金奖(2013年)
组建和率领的厦门大学本科生Nanobiocat团队获得哈佛大学举办的BIOMOD竞赛(International Bio-molecular Design Competition)银奖(2013年)和金奖(2014年)