1991年化学工程与生物工程系成立以后，根据人才培养目标和学科发展趋势，成立了化学工程与技术实验教学中心，中心秉承“以学生为本，以专业技术能力培养为核心”的实验教学理念，统一负责全系的实验教学管理。2013年化学工程与技术实验教学中心获批“福建省化学工程与技术实验教学示范中心”，中心下辖化工技术基础教学实验室、化学工程与工艺专业教学实验室、生物工程专业教学实验室和化工虚拟仿真教学实验室。该中心面向化学工程与工艺、生物工程及化学专业本科生授课。实验中心专职任课老师21名（6名教授、13名副教授、2名助理教授），专职工程与实验技术人员8人，包括高级工程师5人，工程师2人，实验师1人。教学使用面积约1000平方米，拥有仪器设备约600台（套），总价值约1100万元。中心近五年组织本科生积极参加各类课外科技活动，共获得国际、国家级及省级学生课外科技活动奖项23项。其中获得国际金奖2项，国家级奖项12项，省级奖项7项，实验课程分别获得福建省教学改革项目4项，福建省精品资源共享课1项及厦门大学第八届高等教育教学成果一等奖1项。
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